Tại nhiều địa phương trong cả nước đã phát hiện nhiều sai phạm trong công tác đấu thầu thuốc, hóa chất và vật tư y tế. Có tình trạng phân chia nhóm thuốc, lập danh mục thuốc làm tăng giá trị gói thầu, phê duyệt giá trúng thầu quá cao, mua sắm trực tiếp không đúng qui định.