Gắn liền với việc tăng trưởng dư nợ, chất lượng tín dụng của Ngân hàng Chính sách xã hội ngày càng được nâng lên. Vì vậy, tổng nợ quá hạn và nợ khoanh là 1.488 tỷ đồng, chiếm 0,75%/tổng dư nợ, trong đó nợ quá hạn là 807 tỷ đồng, chiếm 0,41%/tổng dư nợ.