Nhóm các vướng mắc của doanh nghiệp hiện nay là vấn đề kiểm tra chuyên ngành, hệ thống công nghệ thông tin, xuất xứ hàng hóa... Do đó, Cục Hải quan TP HCM đang triển khai nhiều giải pháp để tạo thuận lợi thương mại cho các doanh nghiệp hoạt động xuất nhập khẩu.