Nguyên nhân của việc thất thu thuế đối với doanh nghiệp FDI đã được ngành thuế chỉ ra từ rất lâu. Bản thân ngành thuế đã thực hiện hàng loạt giải pháp hạn chế tình trạng doanh nghiệp chuyển giá. Nhưng thực tế đặt ra nhiều vấn đề trong đấu tranh chống chuyển giá dường như vẫn nằm ngoài tầm kiểm soát của ngành.