Dự kiến, Nhà nước sẽ nắm giữ 65% vốn điều lệ tại Công ty mẹ – Vinalines, các nhà đầu tư trong và ngoài nước được mua không quá 35% vốn; Vinalines cũng nắm giữ cổ phần chi phối tại 11 cảng biển, trong đó cảng Hải Phòng, cảng Sài Gòn và cảng Đà Nẵng Vinalines nắm giữ 65% vốn điều lệ.

Liên quan đến hai phương án lập liên doanh cảng Cái Cui giữa Tổng công ty Tân cảng Sài Gòn (SNP) và Tổng công ty Hàng hải Việt Nam (Vinalines), SNP đã lên tiếng không đồng ý với phương án liên doanh ba bên, tức SNP và Vinalines mỗi bên nắm giữ 49% cổ phần và Cần Thơ tham gia 2% còn lại.

Tổng công ty Hàng hải Việt Nam (Vinalines) và Tập đoàn Công nghiệp Than – Khoáng sản Việt Nam (TKV)  ký kết thỏa thuận hợp tác chiến lược vào ngày 9/3 vừa qua.