AJCEP áp dụng thủ tục cấp chứng nhận xuất xứ truyền thống, thực hiện bởi cơ quan, tổ chức có thẩm quyền của Nhà nước hoặc được Nhà nước ủy quyền của nước xuất khẩu.

Tại Việt Nam và các nước ASEAN, doanh nghiệp nhận C/O bản giấy từ cơ quan cấp C/O và gửi bản giấy này cho người nhập khẩu trong AANZFTA.