Kết luận thanh tra của Bộ Công Thương đã chỉ ra hàng loạt sai phạm, khuyết điểm trong công tác quản lý đầu tư xây dựng và hoạt động sản xuất kinh doanh tại dự án Nhà máy sản xuất Đạm Ninh Bình. Theo đó, Đạm Ninh Bình cũng liên tục lỗ từ năm 2012 đến năm 2015.