Kết luận của Thanh tra Chính phủ cho thấy nhiều vấn đề trong khâu đấu thầu lựa chọn nhà thầu tư vấn lập dự án và công tác thẩm định tổng mức đầu tư tại dự án mở rộng nhà máy phân đạm Hà Bắc, chính những điều này là nguyên nhân chính yếu dẫn đến dự án này hoạt động kém hiệu quả, thua lỗ nặng từ năm 2015.