Dự án xây dựng cầu Phú Mỹ được đầu tư theo hình thức hợp đồng BOT do Công ty cổ phần Đầu tư xây dựng Phú Mỹ làm chủ đầu tư với tổng mức đầu tư khoảng hơn 2.078 tỷ đồng. Dự án vướng hàng loạt sai phạm trong quá trình chuẩn bị và thực hiện đầu tư.