Liên quan tới kết quả kiểm toán Nhà máy xử lý nước thải Yên Sở, Kiểm toán Nhà nước đã chỉ ra hàng loạt sai sót trong công tác quản lý, chỉ đạo thực hiện nội dung và kết quả thực hiện các mục tiêu tại dự án này.