Chấp thuận đầu tư khi dự án chưa đủ căn cứ pháp lý, giấy phép xây dựng không phủ hợp với quy hoạch, giao đất không đúng chủ trương sử dụng, DN chi hoa hồng cao bất thường,... là những vi phạm mà Kiểm toán Nhà nước phát hiện ra trong quá trình kiểm tra tại các địa phương.