Huyện Diên Khánh có diện tích là 343,8 km2, bao gồm 19 đơn vị hành chính cấp xã. Khu vực nội thị dự kiến có diện tích là 111,1 km2 với 10 đơn vị hành chính cấp xã. Dự kiến trong thời gian tới hai xã Diên An và Diên Toàn của huyện này sẽ sáp nhập vào TP Nha Trang.