Thông tư 38/2015 đã là một bước cải cách thủ tục hành chính mới, tạo thuận lợi cho doanh nghiệp trong hoạt động xuất nhập khẩu thời gian qua tuy nhiên, tại Dự thảo mới này, nhiều thủ tục đã bị xiết chặt hơn so với Thông tư 38.
Lãnh đạo Cục Thuế nhận định việc doanh nghiệp lập hai hệ thống sổ kế toán khác nhau để theo dõi thực tế hoạt động sản xuất kinh doanh và cung cấp cho cơ quan quản lý nhà nước không chỉ làm thất thu ngân sách nhà nước mà còn gây ảnh hưởng lâu dài cho nền kinh tế và môi trường kinh doanh.