Bên cạnh những thành tựu đáng kể trong thu hút FDI và thu ngân sách Nhà nước, tỉnh Bắc Ninh cũng gặp phải một vài khó khăn về tình hình sản xuất kinh doanh, thể hiện ở một số chỉ tiêu như: IIP tháng 10 giảm làm chậm tốc độ tăng trưởng IIP bình quân, vốn đăng ký thành lập doanh nghiệp mới giảm mạnh…