Tuy mở ra cho doanh nghiệp một kênh huy động vốn mới và gia tăng hiện diện hình ảnh của công ty nhưng IPO cũng gây ra nhiều vấn đề nan giải. Sau khi cân nhắc thiệt hơn, nhiều doanh nghiệp từ chối IPO dù bị cổ đông thúc giục.
Theo kết luận của Thanh tra Chính phủ, hoạt động phát hành trái phiếu tại nhiều doanh nghiệp còn tồn tại nhiều sai phạm, như sử dụng vốn không đúng phương án, hồ sơ phát hành chưa đáp ứng quy định và vi phạm nghĩa vụ công bố thông tin.