Theo Báo cáo tài chính quý III/2016 được Công ty Cổ phần Thế giới số Trần Anh công bố ngày 12/10/2016, hệ thống này lỗ 5,89 tỷ đồng trong quý III/2016, chấm dứt chuỗi 7 quý liên tiếp có lãi trước đó.
Tổng Giám đốc MB cho biết ngân hàng hiện có tham gia tài trợ một dự án trong số 18 dự án đặc biệt được loại trừ khỏi "room" tín dụng, tuy nhiên việc tham gia hay không sẽ không ảnh hưởng lớn với việc tăng quy mô tài sản của ngân hàng.