Các nước phát triển (trong đó có Việt Nam) đang thất thu 100 tỷ USD/năm do hoạt động tránh thuế của các tập đoàn đa quốc gia. Việc ưu đãi thuế đặc khu có thể làm trầm trọng hóa vấn đề thất thu thuế từ hoạt động chuyển giá của khối DN FDI và lo ngại DN Việt né thuế bằng cách chuyển lợi nhuận sang các đơn vị ở ngoài đặc khu.
Người đứng đầu Chính phủ yêu cầu NHNN chỉ đạo các TCTD nâng cao năng lực quản trị, tài chính, quản trị rủi ro, kiểm soát nội bộ, tuân thủ các giới hạn an toàn, kiểm soát chặt các giao dịch với cổ đông, người có liên quan, bảo đảm an toàn hệ thống.