Theo VCCI, quy định về đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng đang gây tác động không mong muốn là bảo hộ ngược, khuyến khích nhập khẩu hàng hoá thay vì sản xuất trong nước. Hàng hoá nhập khẩu có chi phí thuế thấp hơn so với hàng hoá sản xuất trong nước chính là chi phí thuế GTGT chưa được khấu trừ kể trên.

Bộ Tài chính cho biết tại dự án Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của 6 Luật thuế, phân bón sẽ được chuyển sang đối tượng chịu thuế VAT với thuế suất ưu đãi 5%.

Theo nhận định của công ty chứng khoán, động lực chính của ngành phân bón trong năm 2018 chủ yếu đến từ câu chuyện thay đổi chính sách thuế VAT và thoái vốn hơn là tăng trưởng kết quả kinh doanh do giá dầu có xu hướng tăng, trong khi nhiều nhà máy phân bón được xây dựng mới hoặc tăng công suất.

Hiện tại Bộ Tài chính đang đề nghị phương án sẽ áp thuế VAT đầu ra 5% vào ngày 1/1/2019 đối với các sản phẩm phân bón. Nếu phương án này được thông qua, VCBS nhận đjnh lợi nhuận DPM ước tính tăng thêm 130 tỷ đồng, tương ứng 9,5%.